جهت کنترل و کاهش مصرف آب در بخش تخلیه گوجه و شستشو و نوار سورتینگ، که بیشترین مصرف آب نیز در این دستگاه مورد استفاده قرار می گیرد، فیلترهای فیزیکی آب وظیفه جدا سازی برگ و ساقه و گل و لایی که همراه با گوجه ها به خط تولید منتقل می شوند را دارد .  

فیلتز فیزیکی آب، باعث برگشت پذیری آب به چرخه شستشو در حوضچه تخلیه گوجه ها خواهد شد، بسیاری از کارخانه ها برای بهبود شرایط آب از دستگاه تصفیه مخصوص و یا حوضچه آرامش ( سپتیک) که در زیر حوضچه تخلیه پیش بینی می شود استفاده می کنند .

در بخش زیرین حوضچه تخلیه گوجه کانال کشی همراه با مش هایی تعبیه شده است تا از ورود گوجه به داخل این کانال جلوگیری نماید ولی کلیه گل و لای، برگ و ساقه، و مواد زائدی که در حین خیساندن گوجه و یا شستشوی اولیه از گوجه ها جدا می شوند به این بخش منتقل می شود. پمپ سیرکوله که در بخش انتهایی حوضچه قرار گرفته است وظیفه انتقال این آب همراه با تفاله ها را به فیلتر فیزیکی دارد . در فیلتر فیزیکی با چرخش یک استوانه که دارای مش های ریزی بر روی آن است آب همراه با تفاله پمپاژ می شود به گونه ای که تفاله ها بر روی استوانه مش دار قرار می گیرند و آب از مش عبور می کند، استوانه با هر بار چرخش به تیغه ثابتی که در لبه دستگاه قرار گرفته است سایده می شود (فاصله بسیار کم) که این امر باعث جداسازی تفاله ها از روی استوانه به بیرون دستگاه می شود و آب نیز از کانال دیگری به حوضچه تخلیه گوجه بر می گردد .