پس از وارد شدن ظروف استریل شده به دستگاه، نوار ترانسپورت و ماردون مخصوص دریافت ظروف، فاصله استانداری بین ظروف ایجاد می کند تا توسط ستاره ورود دستگاه، هر یک از ظروف به نگهدارنده مخصوص خود که در زیر هر پیستون تعبیه شده است تحویل داده شود، اینکار جهت تنظیم دقیق ظروف زیر هر پیستون صورت می گیرد، با قرار گیری هر ظرف زیر پیستون و با چرخش پیستون ها حول محور مرکزی دستگاه، پکینگ هر پیستون با حرکت عمودی که برای انها طراحی شده، از مخزن نگهدارنده پرکن، مواد لازم را در پیستون خود پر می کند و با برعکس شدن حرکت پیستون به سمت پائین هر ظرف به مقدار حجم پیستون، که معمولا توسط اپراتور قابل تنظیم است پر می شود .

با تغییر ارتفاع بخش مرکزی پیستون ها با نوار ترانسپورت دستگاه، امکان پر کردن انواع ظروف در ابعاد و ظرفیت های مختلف وجود دارد، که معمولا این کار توسط plc دستگاه قابل برنامه ریزی می باشد .

متناسب با ظرفیت خط بسته بندی و مقدار وزن پرشدگی هر ظرف، ظرفیت هر دستگاه مشخص می شود . هر چقدر تعداد پیستون های دستگاه بیشتر باشد ظرفیت دستگاه بیشتر خواهد شد، معمولا دستگاه های پرکن روتاری با 8 ، 12، 20، 24، 32 پیستون طراحی و ساخته می شود .

یکی دیگر از بخش های مهم دستگاه، بخش cip می باشد، هر قسمتی از دستگاه که با محصول و مواد در تماس است می بایست در ابتدا و انتهای روز تولید شستشو شود که معمولا با قراردادن نازل هایی در پیستون ها، مخزن های نگهدارنده، و … امکان اتصال لوله های بخش cip (شسشتو مرکزی خط تولید) به این بخش ها مهیا می شود تا شسشتو به صورت اتومات انجام شود .